Полипептидийн пептидийн гинжин хэлхээний дизайны схем ба шийдэл

I. Дүгнэлт
Пептидүүд нь тусгай макромолекулууд бөгөөд тэдгээрийн дараалал нь химийн болон физик шинж чанараараа ер бусын байдаг.Зарим пептидүүдийг нэгтгэхэд хэцүү байдаг бол зарим нь нийлэгжүүлэхэд харьцангуй хялбар боловч цэвэршүүлэхэд хэцүү байдаг.Практик асуудал бол ихэнх пептидүүд усан уусмалд бага зэрэг уусдаг тул бидний цэвэршүүлэх явцад гидрофобик пептидийн харгалзах хэсэг нь усан бус уусгагчид ууссан байх ёстой, Иймээс эдгээр уусгагч эсвэл буфер нь хэрэглэхэд ноцтой нийцэхгүй байх магадлалтай. биологийн туршилтын журмын талаар, ингэснээр техникчдэд пептидийг өөрсдийн зорилгоор ашиглахыг хатуу хориглодог тул судлаачдад зориулсан пептидийн дизайны хэд хэдэн асуудал доор дурдсан болно.

Полипептидийн пептидийн гинжин хэлхээний дизайны схем ба шийдэл
Хоёрдугаарт, синтетик хэцүү пептидийн зөв сонголт
1. Доод зохицуулалттай дарааллын нийт урт
15-аас бага үлдэгдэлтэй пептидийг олж авахад илүү хялбар байдаг, учир нь пептидийн хэмжээ нэмэгдэж, түүхий бүтээгдэхүүний цэвэршилт буурдаг.Пептидийн гинжин хэлхээний нийт урт 20 үлдэгдэлээс хэтрэх тусам бүтээгдэхүүний нарийн тоо хэмжээ нь гол асуудал юм.Олон туршилтаар үлдэгдлийн тоог 20-оос доош буулгаснаар гэнэтийн үр нөлөөг авахад хялбар байдаг.
2. Гидрофобик үлдэгдлийн тоог багасгах
Гидрофобик үлдэгдэл ихтэй пептидүүд, ялангуяа С төгсгөлөөс 7-12 үлдэгдэлтэй бүсэд ихэвчлэн синтетик хүндрэл үүсгэдэг.Энэ нь нийлэгжилтэнд B хэлбэрийн хуудас гарч ирдэг тул энэ нь хангалтгүй хослол гэж үздэг."Ийм тохиолдолд хоёроос илүү эерэг ба сөрөг үлдэгдлийг хувиргах эсвэл пептидийн найрлагыг нээхийн тулд Gly эсвэл Pro-г пептид рүү оруулах нь ашигтай байж магадгүй юм."
3. "Хэцүү" үлдэгдлийн зохицуулалтыг бууруулах
"Цис, Met, Arg, Try зэрэг хэд хэдэн үлдэгдэл байдаг бөгөөд тэдгээр нь ерөнхийдөө нийлэгждэггүй."Ser-ийг ихэвчлэн Cys-ийн исэлдүүлэхгүй хувилбар болгон ашигладаг.
Полипептидийн пептидийн гинжин хэлхээний дизайны схем ба шийдэл

Гуравдугаарт, усанд уусдаг зөв сонголтыг сайжруулах
1. N эсвэл C төгсгөлийг тохируулна уу
Сөрөг цэнэгийг нэмэгдүүлэхийн тулд хүчиллэг пептидүүдтэй харьцуулахад (өөрөөр хэлбэл рН 7-д сөрөг цэнэгтэй), ацетилизаци (N-төгсгөлийн ацетилжилт, C төгсгөл нь үргэлж чөлөөт карбоксилын бүлгийг хадгалдаг) хийхийг зөвлөж байна.Гэсэн хэдий ч үндсэн пептидийн хувьд (өөрөөр хэлбэл, рН 7-д эерэг цэнэгтэй) аминжуулалт (N-төгсгөл дэх чөлөөт амин бүлэг ба C-төгсгөл дэх аминжуулалт) эерэг цэнэгийг нэмэгдүүлэхийг зөвлөж байна.

2. Дараалалыг их хэмжээгээр богиносгох буюу уртасгах

Зарим дараалал нь Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr, Ala гэх мэт олон тооны гидрофобик амин хүчлийг агуулдаг. Эдгээр гидрофобын үлдэгдэл 50% -иас хэтрэх үед тэдгээрийг уусгахад хялбар байдаггүй.Пептидийн эерэг ба сөрөг туйлуудыг нэмэгдүүлэхийн тулд дарааллыг уртасгах нь ашигтай байж болох юм.Хоёр дахь сонголт нь гидрофобик үлдэгдлийг бууруулах замаар эерэг ба сөрөг туйлуудыг нэмэгдүүлэхийн тулд пептидийн гинжин хэлхээний хэмжээг багасгах явдал юм.Пептидийн гинжин хэлхээний эерэг ба сөрөг талууд хүчтэй байх тусам устай урвалд орох магадлал өндөр байдаг.
3. Усанд уусдаг үлдэгдэлд хийнэ
Зарим пептидийн гинжин хэлхээний хувьд эерэг ба сөрөг амин хүчлүүдийн хослол нь усанд уусах чадварыг сайжруулдаг.Манай компани хүчиллэг пептидийн N төгсгөл буюу С төгсгөлийг Glu-Glu-тай хослуулахыг зөвлөж байна.Үндсэн пептидийн N эсвэл C төгсгөлийг өгч, дараа нь Lys-Lys.Хэрэв цэнэглэгдсэн бүлгийг байрлуулах боломжгүй бол Ser-Gly-Ser-ийг N эсвэл C төгсгөлд байрлуулж болно.Гэсэн хэдий ч пептидийн гинжин хэлхээний талуудыг өөрчлөх боломжгүй үед энэ арга ажиллахгүй.